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南京保健食品注册材料的编写，是整体注册三大部分工作中的一个重要组成部分，是产品配方特性展现科学、合理的佐证，是理论与商业化试产的结合，是工厂是否具备生产特殊医学用途配方食品条件的证明，也是注册第二部分现场核查工作的重要复现依据，所以在注册材料的编写过程中，不能落下每一个生产环节，不能落下每一个影响产品质量的因素分析，同时在组织材料过程中要条理清晰，内容详尽，让审核专家清晰明白。完整的注册材料完成网上填报的同时，还要报送纸制材料到审核大厅，纸制材料需要以一份原件七份复印件的形式进行呈报，纸制材料的装订和内容，要保持整洁、完整，与网上填报材料一致，目录索引齐全，方便翻阅及审查。
完整的注册材料信息网上填报，是注册材料备案的依据，是专家审核纸制材料的对比，同时也是专家现场审查的重要依据，所以网上材料的填报必须要与纸制材料一致尤为重要。商业化产线上生产的终产品检测及结果数据的分析和对比，是验证配方设计是否科学、合规、合法性的重要依据，同时也是工艺是否稳定、产品质量是否可控的体现重要方式。数据对比分析和论证，在注册材料中非常重要，也是注册材料的核心数据支撑。商业化试产过程中，每一工序环节的变化，对产品质量是否有影响，影响因素是否在可控范围内，过程中的验证及数据，是产品注册要求中的重要组成部分，也是科学、合理、稳定性论证的重要论据。
原料检测数据是配方衡算的重要依据，也是商业化生产质量稳定的基本因素。同时也是产品质量波动的控制依据。在商业化产线上进行试产，产品质量是否合格、可控，是保障将来产品商业化生产质量稳定、可控的体现;商业化试产过程的相关数据，也是注册材料中重要论证材料之一。注册工作是一项多部门，且相互错综复杂的工作，项目计划表是保证注册工作顺利进行的基础保障。要想注册过程中所有工作受控，一个专业周密的计划表是非常重要的。一套完整的生产质量管理体系，是企业商业化生产质量保证的前提，也是特医注册材料中，体现申请主体具备产品质量把控能力的展现。
